BUGSで学ぶ階層モデリング入門―個体群のベイズ解析― 

書籍情報
ISBN978-4-320-05780-7
判型菊 
ページ数662ページ
発行年月2016年03月
本体価格7,800円
BUGSで学ぶ階層モデリング入門 書影
BUGSで学ぶ階層モデリング入門

 本書は,人間が通常観測することができない生態プロセスを推測する階層モデリングについて,理論とWinBUGSによる実践方法を解説した“Bayesian Population Analysis using WinBUGS: A hierarchical perspective” の邦訳である。
 本書の特徴の1つは,日本語での解説例がほとんどない,生態プロセス推測のための階層モデリングについて詳細に解説している点である。特に野外においては,研究対象である生態プロセス(例えば野生動物の個体数の変動)を直接観測できることはほとんどなく,誤差を含む観測データからこれを推測しなければならない。階層モデルは観測と生態プロセスを明示的に分離することで,古典的な捕獲再捕獲法などと比較して「きれいでない」データに対しても適用できるなど,非常に柔軟な推測を可能とする。
 本書のもう1つの特徴は,階層モデルのベイズ推定に焦点をあて,WinBUGSを統計ソフトウェアRから操作して実行する方法を詳細に解説している点である。MCMC法を実行できるソフトウェアは近年種類が増加しているが,それらのソフトウェアに共通する課題としてデータの読み込みなどの操作性が低いことが挙げられる。RからWinBUGSを扱うことで操作性は飛躍的に向上するが,本書ではそのような方法で階層モデルを解析した例をプログラム付きで多数紹介している。そのため本書はRとBUGS言語の解説書の一面も有している。また,WinBUGSでの解析の実行プログラムはOpenBUGSやJAGSに流用することも容易であり,汎用性が高い。読者が自身の観測データを解析する際に役立つ,非常に実践的な構成となっている。
 さらに本書は階層モデリングの解説だけに留まらず,野外調査につきまとう不完全な観測への対処,特定の階層モデルと関連した調査デザインにも言及している。生態学のみならず,観測できないプロセスの推測に携わるすべての者に必携の書であると言える。

目次

第1章  はじめに

第2章  ベイズ統計モデリングの簡単な紹介

第3章  一般化線形モデル入門:最も単純な計数値データのモデル

第4章  ランダム効果入門:計数値データに対する従来のポアソンGLMM

第5章  個体群の計数値による状態空間モデル

第6章  捕獲再捕獲データによる閉鎖個体群サイズの推定

第7章  Cormack-Jolly-Seber モデルを使った捕獲再捕獲法による生存率の推定

第8章  標識回収データを用いた生存率の推定

第9章  多状態モデルを用いた捕獲再捕獲による生存と移動の推定

第10章  Jolly-Seber モデルと捕獲再捕獲データによる生存,幼生加入,個体群サイズの推定

第11章  統合個体群モデルと複数のデータによる個体群統計パラメータ,個体群サイズ,射影行列の推定

第12章  二項混合モデルとメタ個体群デザインで得られる計数値データを用いた個体数推定

第13章  メタ個体群の検出・不検出データとサイト占有モデルによる占有と種の分布の推定

第14章  終わりに


付録1  WinBUGSのヒント

付録2  さらに便利な2つの多状態捕獲再捕獲モデル

参考文献

索引